Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERVFRD-1P60508 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms