Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms