Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP107P57740 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP107P57740 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP107P57740 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP107P57740 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms