Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN8P56748 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms