Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms