Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCR4P51679 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCR4P51679 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms