Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNTBP49356 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNTBP49356 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTBP49356 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTBP49356 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTBP49356 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTBP49356 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTBP49356 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTBP49356 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNTBP49356 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms