Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms