Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5CP41229 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms