Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms