Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LTBRP36941 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LTBRP36941 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms