Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms