Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP1P30622 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms