Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GJB2P29033 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GJB2P29033 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB2P29033 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB2P29033 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB2P29033 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms