Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD1P28340 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD1P28340 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD1P28340 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms