Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTX3P26022 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTX3P26022 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTX3P26022 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTX3P26022 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms