Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms