Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSPP15924 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSPP15924 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms