Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms