Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms