Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GP1BBP13224 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms