Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms