Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSF1P09603 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF1P09603 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF1P09603 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF1P09603 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF1P09603 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF1P09603 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms