Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL3A1P02461 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL3A1P02461 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms