Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms