Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOBOXO60393 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms