Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms