Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLOCKO15516 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms