Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCAMP3O14828 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms