Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3AO14802 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms