Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POTEMA6NI47 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms