Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XIRP2A4UGR9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms