Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms