Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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PTPRQQ9UMZ3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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PTPRQQ9UMZ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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