Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYH13Q9UKX3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms