Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXO9Q9UK97 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO9Q9UK97 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms