Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGA1Q9UJY5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms