Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms