Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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RABGEF1Q9UJ41 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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RABGEF1Q9UJ41 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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RABGEF1Q9UJ41 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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RABGEF1Q9UJ41 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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RABGEF1Q9UJ41 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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RABGEF1Q9UJ41 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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RABGEF1Q9UJ41 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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RABGEF1Q9UJ41 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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RABGEF1Q9UJ41 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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RABGEF1Q9UJ41 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1Q9UJ41 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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