Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK4Q9UBT3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms