Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC180Q9P1Z9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms