Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms