Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms