Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE4Q9NR33 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms