Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms