Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COMMD5Q9GZQ3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms