Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms