Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP1Q9C000 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms