Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT11Q9BT88 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms