Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF559Q9BR84 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms